La hipermutación en la sección GAG-POL y su relación con la falla en la genotipificación del VIH
DOI:
https://doi.org/10.21142/cient.v13i1.320Palabras clave:
Transcriptasa reversa, Cebadores, Antiretrovirales, VIHResumen
La genotipificación es un proceso de
suma importancia en la terapéutica
de los pacientes con VIH. Para
llevarlo a cabo, se necesita amplificar
correctamente la secuencia a estudiar.
Se estudió la sección gag-pol del VIH
en 12 muestras clínicas usando PCRPro
viral, los cebadores de esta etapa
fueron evaluados por bioinformática.
Adicionalmente, se amplificó la región env
y la beta-globina, para evaluar diferentes
cebadores y la extracción de ácidos
nucleicos, respectivamente. Usando los
cebadores para amplificar la sección
gag-pol, no se obtuvieron amplicones,
y usando la bioinformática se observó
deficiencia de los cebadores para unirse
a la sección blanco, en contraste con
las secciones conservadas env y betaglobina,
donde sí hubo amplificación. Por
tanto, se determinó que los cebadores
para genotipificar la sección gag-pol
no estarían uniéndose correctamente
a la sección blanco, por presentar
mutaciones.
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